| 1964 | Weilin & Göös-Preis (Helsinki) für die Anthologie Moderne finnische Lyrik |
| 1969 | Stipendiat des Tschechoslowakischen Schriftstellerverbands Prag |
| 1974 | Finnischer Staatspreis für die Prosaanthologie Finnland |
| 1984 | Peter-Huchel-Preis für den Band Gegenzeichnung. Gedichte 1962-1982. |
| 1985 | Stipendiat des Berliner Senats |
| 1992 | Horst-Bienek-Sonderpreis für Lyrik der Bayerischen Akademie der Schönen Künste für die Anthologie Auf der Karte Europas ein Fleck |
| 1994 | Künstlerrente des finnischen Unterrichtsministeriums |
| 1996 | Stipendiat des Künstlerhauses Schloss Wiepersdorf |
| 1999 | Paul Scheerbart-Preis für Lyrikübersetzungen |
| 2002 | Nossack-Preis für Dichter und ihre Übersetzer der Akademie der Wissenschaften und der Literatur (Mainz) (für die Haavikko-Übersetzungen) |
| 2004 | Lettischer Literaturpreis für das übersetzerische Lebenswerk |
| 2006 | Rainer Malkowski-Preis (Bayerische Akademie der schönen Künste): Rainer-Malkowski-Stiftung Adolf Muschg: Laudatio auf Manfred Peter Hein 29. Juni 2006 (pdf-Datei) Danksagung von Manfred Peter Hein (pdf-Datei) |
| 2011 | Verleihung der Ehrendoktorwürde der Johannes Gutenberg-Universität Mainz für seine Vermittlerleistung zwischen den europäischen Literaturen |
| 2015 | Verleihung des Bundesverdienstkreuzes |